Rutinně prováděná vyšetření - laboratoř molekulární biologie
Sexuálně přenosná onemocnění
CELIAKIE – rizikové HLA alely
Virové hepatitídy
RNA HCV (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: monitorování replikace viru - úspěšnosti léčby
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ < 600 IU/ml nebo např. 2E+5 IU/ml (200 000 IU/ml)
Výsledek do: 1 týdne, provádí se pouze u RNA HCV pozitivních vzorků
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
Genotyp HCV
Metoda: PCR
Indikace: stanovení genotypu HCV - podklad pro postup léčby
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: 1a/b, 2a/c, 2b, 3a, 4
Výsledek do: 2 týdnů, provádí se pouze u RNA HCV pozitivních vzorků
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
DNA HBV (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: průkaz produktivní infekce HBV - stanovení replikace viru monitorování replikace viru - úspěšnosti léčby
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, do 1E+05cp/ml slabě POZITIVNÍ + kvantita, nad 1E+05cp/ml POZITIVNÍ + kvantita
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
Genotyp HBV
Metoda: PCR
Indikace: stanovení genotypu HBV - podklad pro postup léčby
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: typ A, B, C, D, E, F
Výsledek do: 1 měsíce
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
Precore HBV
Metoda: PCR
Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutací v oblasti PreCore
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem
Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
BCP HBV
Metoda: PCR
Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutací v oblasti Basal Core Promotor
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem
Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
Lékové rezistence HBV (lamivudin, adefovir, entecavir, telbivudin. emtricitabin, tenofovir)
Metoda: PCR
Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutace v oblasti YMDD
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: CITLIVÝ REZISTENTNÍ s komentářem
Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
RNA HEV
Metoda: PCR
Indikace: průkaz akutní infekce HEV
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml , stolice velikost lískového oříšku
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
RNA HGV
Metoda: PCR
Indikace: průkaz produktivní infekce HGV - stanovení replikace viru
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
Herpetické viry
DNA CMV (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: infekce herpetickými viry
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 1,5ml , moč, plodová voda 2ml , stěr*
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: 0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní)např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média
DNA HSV1/2
Metoda: PCR
Indikace: infekce herpetickými viry
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 1,5ml , stěr*
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ HSV1 nebo HSV2
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média
DNA EBV (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: infekce herpetickými viry
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 1,5ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
DNA VZV
Metoda: PCR
Indikace: infekce herpetickými viry
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 1,5ml , stěr*
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média
DNA HHV6 (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: infekce herpetickými viry
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 1,5ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: 0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní)
např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
Respirační viry
RNA Influenza A, B
Metoda: PCR
Indikace: respirační infekce
Materiál: výtěr z nosu a krku *
Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ Influenza A nebo Influenza B
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab
RNA Influenza A – typizace (H1N1 2009, H1, H3)
Metoda: PCR
Indikace: respirační infekce
Materiál: výtěr z nosu a krku *
Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru
Forma výsledku: Influenza A (H1N1 2009), Influenza A (H1N1), Influenza A (H3N2)
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab
RNA Parainfluenza 1, 2, 3
Metoda: PCR
Indikace: respirační infekce
Materiál: výtěr z nosu a krku *
Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ Parainfluenza 1, 2 nebo 3
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab
RNA RSV A, B
Metoda: PCR
Indikace: respirační infekce
Materiál: výtěr z nosu a krku *
Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ RSV A nebo RSV B
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab
Arboviry
RNA TBEV (virus klíšťové encefalitidy)
Metoda: PCR
Indikace: klíšťová encefalitida
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 0,5ml
Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
RNA West Nile virus
Metoda: PCR
Indikace: západonilská horečka
Materiál: likvor min.1,5ml , sérum, plazma (EDTA krev) 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
RNA Hantavirus
Metoda: PCR
Indikace: hemoragická horečka s ledvinovým syndromem
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
RNA Alphavirus
Metoda: PCR
Indikace:
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 0,5ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
RNA Dengue virus
Metoda: PCR
Indikace: horečka dengue
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
Ostatní viry
RNA Enterovirus
Metoda: PCR
Indikace: aseptické meningitidy a encefalitidy
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml , likvor 1,0ml , stěr*, stolice velikost lískového oříšku
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
DNA Parvovirus B19 (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: pátá nemoc
Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
RNA Parotitis
Metoda: PCR
Indikace: příušnice
Materiál: výtěr bukální sliznice*, sliny, moč, likvor 1,0ml
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab
DNA Adenovirus
Metoda: PCR
Indikace: keratokonjuktivitida, respirační infekce
Materiál: výtěr/ stěr*
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média
DNA BK virus (včetně kvantifikace)
Metoda: PCR
Indikace: BK virová nefropatie u pacientů po transplantaci ledvin
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, moč 2ml
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: 0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní)
např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
Sexuálně přenosná onemocnění
DNA Chlamydia trachomatis
Metoda: genová sonda, PCR
Indikace: onemocnění urogenitálního systému, konjuktivitidy
Materiál: Genová sonda: výtěr z uretry, spojivky (souprava Gen-Probe), výtěr z cervixu (souprava Digene)
PCR: moč, punktáty, výtěr dakronovým* tampónem nebo kartáčkem
Transport: Genová sonda: Při 2-25°C, do 14 dní
PCR: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.
Forma výsledku: Genová sonda: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)
PCR: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: Genová sonda: 3 dnů
PCR: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316
* odběrová souprava eSwab
DNA Neisseria gonorrhoeae
Metoda: genová sonda, PCR
Indikace: onemocnění urogenitálního systému, konjuktivitidy
Materiál: Genová sonda: výtěr z uretry, spojivky (souprava Gen-Probe), výtěr z cervixu (souprava Digene)
PCR: moč, výtěr dakronovým* tampónem nebo kartáčkem
Transport: Genová sonda: Při 2-25°C, do 14 dní
PCR: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.
Forma výsledku: Genová sonda: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)
PCR: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: Genová sonda: 3 dnů
PCR: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316
* odběrová souprava eSwab
DNA Mycoplasma genitalium
Metoda: PCR
Indikace: onemocnění urogenitálního systému
Materiál: moč, výtěr z uretry dakronovým tampónem*
Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316
* odběrová souprava eSwab
DNA Mycoplasma hominis
Metoda: PCR
Indikace: onemocnění urogenitálního systému, jiné infekce
Materiál: moč 20ml , výtěr z uretry nebo cervixu dakronovým tampónem (odběrová souprava eSwab), likvor 1ml , BAL , sputum min 2ml , punktát 1ml , krev (EDTA) 4ml
Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. molekulární biologie, tel.: 596 200 241, 147, 266 Oddělení bakteriologie a mykologie, Laboratoř fluorů a STI
DNA Ureaplasma sp.
Metoda: PCR
Indikace: onemocnění urogenitálního systému, jiné infekce
Materiál: moč 20ml , výtěr z uretry nebo cervixu dakronovým tampónem (odběrová souprava eSwab), likvor 1ml , BAL , sputum min 2ml , punktát 1ml , krev (EDTA) 4ml
Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4°C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne
Kontakt: Odd. molekulární biologie, tel.: 596 200 241, 147, 266 Oddělení bakteriologie a mykologie, Laboratoř fluorů a STI
DNA HPV high risk, low risk
Metoda: genová sonda
Indikace: cervikální léze
Materiál: výtěr z cervixu (souprava Digene)
Transport: Při 2-25°C, do 14 dní
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)
Výsledek do: 3 dnů
Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316
Mykobakteria
DNA Mycobacterium tuberculosis
Metoda: PCR z klinických vzorků
Indikace: podezření na TBC
Materiál: krev nesrážlivá 4ml (natricum citricum 3,8% + krev v poměru 1:4), laryngeální výtěr 6 tamp. , vzorky z bronchoskopie 3x3x1 mm , moč 50ml , stolice velikost lískového ořechu , sputum, likvor, pleurální punktát, aspirát a další 2ml
Transport: při 4°C až pokojové teplotě max. 1den
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 2 až 7 pracovních dnů
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
RNA Mycobacterium tuberculosis complex
Metoda: MTD z klinických vzorků
Indikace: podezření na TBC
Materiál: laryngeální výtěr 6 tamp. , vzorky z bronchoskopie 3x3x1 mm , moč 50ml , stolice velikost lískového ořechu , sputum, likvor, pleurální punktát, aspirát a další 2ml
Transport: při 4°C až pokojové teplotě max. 1den
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 2 až 7 pracovních dnů
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
DNA M. kansasii
Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením
Indikace: určení mykobakteriálního druhu
Materiál: izolovaný kmen
Forma výsledku: prokázáno M. kansasii
Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
DNA M. gordonae
Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením
Indikace: určení mykobakteriálního druhu
Materiál: izolovaný kmen
Forma výsledku: prokázáno M. gordonae
Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
DNA M. avium – intracellulare complex
Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením
Indikace: určení mykobakteriálního kmene
Materiál: izolovaný kmen
Forma výsledku: prokázán komplex M.avium - intracellulare
Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
DNA M. avium
Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením
Indikace: určení mykobakteriálního druhu
Materiál: izolovaný kmen
Forma výsledku: prokázáno M. avium
Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
DNA M. intracellulare
Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením
Indikace: určení mykobakteriálního druhu
Materiál: izolovaný kmen
Forma výsledku: prokázáno M. intracellulare
Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223
Bakteriální meningitidy
Bakteriální meningitidy
DNA N. meningitidis
DNA N. meningitidis typizace B,C
DNA S. pneumoniae
DNA H. influenzae
DNA L. monocytogenes
Metoda: PCR
Indikace: bakteriální meningitidy
Materiál: likvor 0,5 - 1 ml, plná krev (EDTA nebo citrátová) 5 ml. Materiál odeberte pouze pro vyšetření DNA!!!, sterilně do umělohmotné šroubovací zkumavky. Pro bakteriologické kultivační vyšetření odeberte druhý vzorek.
Transport: likvor při 4°C, krev při pokojové teplotě do 12 h od odběru, nad 12 h od odběru likvor zamražen a krev při 4°C
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 179, 425
Atypické pneumonie
DNA Legionella pneumophila
Metoda: PCR
Indikace: atypická pneumonie
Materiál: BAL, sputum, tracheální aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotek min. 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne
Kontakt: Oddělení bakteriologie tel.: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie tel.: 596 200 225
DNA Mycoplasma pneumoniae
Metoda: PCR
Indikace: atypická pneumonie
Materiál: BAL, sputum, pleurální výpotek min. 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne
Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328 Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
DNA Chlamydia pneumoniae
Metoda: PCR
Indikace: atypická pneumonie
Materiál: BAL, sputum, pleurální výpotek min. 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne
Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328 Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341
Sepse
G+ hemokultury - identifikace
Metoda: PCR
Indikace: sepse
Materiál: signál pozitivní hemokultura min. 1ml
Transport: při lab °C do 48 h od odběru
Forma výsledku: druhová identifikace
Výsledek do: denně
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328
G- hemokultury - identifikace
Metoda: PCR
Indikace: sepse
Materiál: signál pozitivní hemokultura min. 1ml
Transport: při lab °C do 48 h od odběru
Forma výsledku: druhová identifikace
Výsledek do: denně
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328
Ostatní bakterie
DNA Borrelia burgdorferi
Metoda: PCR
Indikace: podezření na boreliózu
Materiál: likvor min.1,5ml , punktát min. 1,5ml , moč, plazma (EDTA krev) 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne
Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240
Druhová identifikace Borrelia burgdorferi sensu stricto / afzelii / garini
Metoda: PCR RFLP
Indikace: borelióza
Materiál: likvor min.1,5ml , punktát min. 1,5ml , moč, plazma (EDTA krev) 2ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: druhová identifikace
Výsledek do: 2 týdnů
Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240
DNA Bordetella pertusis
Metoda: PCR
Indikace: dávivý kašel
Materiál: nasofaryngeální výtěr*
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s médiem eSwab
DNA Bordetella parapertusis
Metoda: PCR
Indikace: dávivý kašel
Materiál: nasofaryngeální výtěr*
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s médiem eSwab
DNA Helicobacter pylori
Metoda: PCR
Indikace:
Materiál: biopsie
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225
Průkaz toxinů A, B Clostridium difficile
Metoda: PCR
Indikace: pseudomembránová kolitida
Materiál: bakteriální kmen
Transport: při lab°C do 48 h od odběru
Forma výsledku: A-/B-, A-/B+, A+/B+
Výsledek do: 2 týdnů
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328
DNA Leptospira sp.
Metoda: PCR
Indikace: leptospiróza
Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor min.1,5ml, moč, sklivec, biopsie
Transport: při 4°C do 12 h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240
Paraziti
DNA Toxoplasma gondii
Metoda: PCR
Indikace: toxoplasmóza
Materiál: plná krev (EDTA) 5ml , plodová voda, sklivec, likvor min. 1,5ml
Transport: při 4°C do 12 h od odběru, krev nemrazit !!!
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)
Kontakt: Odd. molekulární biologie, tel.: 596 200 241, 147, 266 Oddělení parazitologie a lékařské zoologie, tel.: 596 200 326, 240
Houby
DNA Pneumocystis jirovecii
Metoda: PCR
Indikace: pneumonie
Materiál: BAL, sputum min. 2ml
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ
Výsledek do: týdne
Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava tel.: 596 200 425, 328
Sekvenace
Sekvenační identifikace baktérií (16S DNA)
Metoda: sekvenování
Materiál: bakterialní kmen
Transport: při lab°C do 48 h od odběru
Forma výsledku: druhová identifikace
Výsledek do: 2 týdnů
Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225
Sekvenační identifikace hub (D2 LSU)
Metoda: sekvenování
Materiál: bakterialní kmen
Transport: při lab°C do 48 h od odběru
Forma výsledku: druhová identifikace
Výsledek do: 2 týdnů
Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225
Sekvenační identifikace Legionella species (MIP)
Metoda: sekvenování
Materiál: bakterialní kmen
Transport: při lab°C do 48 h od odběru
Forma výsledku: druhová identifikace
Výsledek do: 2 týdnů
Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225
Sekvenační subtypizace Legionella penumophila
Metoda: sekvenování
Materiál: bakterialní kmen
Transport: při lab°C do 48 h od odběru
Forma výsledku: SBT typ
Výsledek do: 1 měsíce
Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225
Celiakie
Rizikové HLA alely
Metoda: PCR
Indikace: vyšetření genetické dispozice pro celiakii – nepřítomnost heterodimeru HLA DQA1*0501/DQB1*0201 (DQ2) vylučuje celiakii na 95% HLA DQA1*0301/DQB1*0302 (DQ8)
Materiál: EDTA krev, 2ml
Transport: při 4°C do 12h od odběru
Forma výsledku: nízké riziko, VYSOKÉ RIZIKO s komentářem
Výsledek do: 1 měsíce
Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225